Et viktig arbeidsområde for LVK har i alle år vært å arbeide for at de større vannkraftanleggene ikke påfører naturmangfoldet og vassdragsmiljøet større skader og ulemper enn strengt nødvendig. EUs vanndirektiv (direktiv 2000/60/EC) har det samme formålet, og gjelder gjennom EØS-avtalen også norske regulerte vassdrag. Vanndirektivet ble innført i Norge gjennom forskrift om rammer for vannforvaltningen (vannforskriften) i 2007. Derfor er det en viktig oppgave for LVK å følge opp den utviklingen i vanndirektivet som i stadig større grad stiller strengere miljøkrav også til norsk vannkraft.
I januar 2022 ba ESA, EØS-avtalens overvåkningsorgan, norske myndigheter ved Klima- og Miljødepartementet om å besvare en rekke spørsmål om etterlevelsen av vanndirektivet. Bakgrunnen for henvendelsen var at ESA har besluttet å åpne undersøkelsessak mot Norge, blant annet som følge av at LVK sammen med flere naturvern- og friluftsorganisasjoner over flere år har reist spørsmål ved om Norges praksis i arbeidet med vannforvaltningsplanene er i strid med vanndirektivet. LVK har blant annet påpekt at miljømålene i henhold til direktivet må være styrende for påfølgende vilkårsrevisjoner, og ikke være avhengig av forutgående vedtak etter nasjonalt lovverk.
Ved brev 29. september 2022 besvarte norske myndigheter brevet fra ESA. Den 16. juni 2023 sendte LVK, sammen Sabima, Norske Lakseelver, Norsk Friluftsliv, DNT, Naturvernforbundet og NJFF et felles brev til ESA der det er påpekt flere svakheter og unøyaktigheter i regjeringens redegjørelse for hvordan Norge sikrer gjennomføring av vanndirektivet i vannkraftpåvirkede vassdrag.
I brevet er organisasjonene i utgangspunktet enige med norske myndigheter i at det finnes juridiske verktøy i det norske regelverket som i prinsippet kan brukes for å oppfylle forpliktelsene etter direktivet. Problemet slik organisasjonene ser det, er imidlertid at disse verktøyene ikke blir benyttet i praksis. Organisasjonene anså det derfor som helt nødvendig å sende inn dette brevet med ytterligere kommentarer til norske myndigheters implementering av direktivet.
Hele dialogen mellom ESA, norske myndigheter, LVK og naturvern- og friluftsorganisasjoner om etterlevelsen av vanndirektivet på norsk vannkraft fra 2011 og frem til i dag finner du på denne siden.